Сравнительное богословие выделяет пять основных исповеданий (конфессий):
- православие
- римо-католичество
- лютеранство
- кальвинизм (реформатство)
- англиканство
Три последних обозначают общим названием «протестантских исповеданий». Католицизм и протестантизм иногда объединяют в «западное христианство».
Различия в вероучении могут касаться вопросов догматики (например, filioque), сотериологии (например, чистилище) или сакраментологии (например, утраквизм)
Главным практическим вопросом сравнительного богословия являются возможности и перспективы межконфессионального диалога, а также выработка конкретных мер по воцерковлению лиц иных конфессий («чин воссоединения инославных» посредством крещения и/или миропомазания). Теоретическим аспектом этого вопроса является проблема присутствия благодати в иных конфессиях и выяснение «степени поврежденности церковной природы». Важную роль в сохранении единого христианского сознания играет учение о Троице, концепция Боговоплощения и апостольская преемственность.